Trong tháng 7 và tháng 8.2008, HĐDT đã tổ chức 6 Đoàn giám sát tại 11 tỉnh về việc thực hiện Chương trình 135 giai đoạn II. Theo dự thảo báo cáo kết quả giám sát, từ năm 2006-2008, Chương trình 135 đã được đầu tư hơn 7.000 tỷ đồng, ưu tiên phát triển đồng bộ kinh tế - xã hội ở các xã đặc biệt khó khăn, giúp cho bộ mặt nông thôn, các xã đặc biệt khó khăn có những thay đổi căn bản, nhất là về cơ sở hạ tầng. Qua giám sát, HĐDT nhận thấy Chương trình 135 vẫn còn một số tồn tại: chương trình triển khai chưa đồng bộ, tiến độ chậm so với kế hoạch; Một số văn bản hướng dẫn thực hiện ban hành chậm, chưa phù hợp với tình hình thực tế, chồng chéo, khó triển khai thực hiện, phải thay đổi, điều chỉnh nhiều lần... Đoàn giám sát của HĐDT kiến nghị với QH và UB TVQH cần quan tâm hơn nữa để tăng thêm nguồn lực cho Chương trình 135 giai đoạn II, chỉ đạo điều hòa các cơ quan QH, các Đoàn ĐBQH và HĐND các cấp tích cực giám sát kết quả thực hiện chương trình.
Phát biểu ý kiến tại phiên họp, đại diện các bộ, ngành hữu quan đều cơ bản nhất trí với dự thảo báo cáo kết quả giám sát của Thường trực HĐDT. Các ĐB cũng yêu cầu cần làm rõ định mức giữa nguồn vốn đầu tư trong tổng số ngân sách đã đầu tư cho Chương trình 135 giai đoạn II; Cần sớm hoàn thiện và ban hành các biểu chỉ số theo dõi giám sát, đánh giá việc thực hiện Chương trình 135...