Theo Ban soạn thảo, dự thảo Luật Giáo dục đại học gồm 9 Chương, 50 Điều; được xây dựng dựa trên nguyên tắc thể chế hóa đường lối và các quan điểm cơ bản của Đảng về phương hướng phát triển giáo dục và đào tạo, đồng thời tăng cường sự tham gia của xã hội đối với việc xây dựng và nâng cao chất lượng giáo dục đại học. Dự thảo Luật quy định chi tiết, cụ thể hóa những nội dung về giáo dục đại học đã được quy định trong Luật Giáo dục nhưng còn mang tính khái quát. Một số quy định của Luật Giáo dục liên quan đến giáo dục đại học được sửa đổi, bổ sung cho phù hợp với tình hình thực tiễn giáo dục đại học của nước ta và xu thế phát triển của giáo dục đại học thế giới.
Các đại biểu tham gia hội nghị tán thành với sự cần thiết ban hành Luật Giáo dục đại học. Tuy nhiên, một số ý kiến nhấn mạnh, trong hệ thống pháp luật về giáo dục, Luật Giáo dục mới là "luật khung", còn Luật Giáo dục đại học là luật chuyên ngành. Do đó, xét về mặt kỹ thuật xây dựng văn bản pháp luật, dự thảo Luật Giáo dục đại học phải quy định hết sức cụ thể, chi tiết, tránh tối đa việc ban hành các văn bản dưới luật khiến luật chậm đi vào cuộc sống. Dự thảo Luật cũng phải thể hiện được quan điểm, tư duy đổi mới trong quản lý giáo dục đại học là đề cao quyền tự chủ của các cơ sở giáo dục đại học để việc thực hiện quyền tự chủ, tự chịu trách nhiệm không còn là khẩu hiệu, hình thức. Theo đó, cần quy định cụ thể quyền tự chủ của các cơ sở giáo dục đại học về chuyên môn, tài chính, nhân sự; quyền hạn và nhiệm vụ của các tổ chức, cá nhân trong nhà trường, đồng thời có các chế tài để bảo đảm các cơ sở giáo dục đại học hoạt động đúng quy định của pháp luật hay có những quy định cứng về bảo đảm chất lượng đào tạo…
Một số ý kiến khác cũng đề nghị, cần xem lại mô hình đại học quốc gia, đại học vùng và mối quan hệ với các trường đại học thành viên, nhất là về quyền tự chủ, tự chịu trách nhiệm.