Trong năm 2007 và những tháng đầu năm 2008 đã xảy ra một số trường hợp trẻ em bị tử vong sau khi tiêm vắc xin phòng bệnh. Điều này đã gây ra mối lo ngại cho gia đình có trẻ trong độ tuổi cần tiêm chủng cũng như tỷ lệ tiêm chủng ở nước ta đang giảm xuống. Tuy nhiên, phải khẳng định rằng thông tin trẻ tử vong liên quan đến tiêm vắc xin chỉ là những thông tin được đưa ra do phỏng đoán mà chưa hề có một kết luận chính thức nào của các cơ quan có chức năng.
Theo ông Jean Marc Olivier đại diện tổ chức Y tế thế giới tại Việt Nam cho biết, trẻ em tử vong sau khi tiêm chủng có 5 nguyên nhân chính: phản ứng do vắc xin; do sự sai sót trong hệ thống như bảo quản, vận chuyển, tiêm vắc xin; sự trùng hợp ngẫu nhiên (không phải do vắc xin); phản ứng sau tiêm (sưng đau, sốt nhẹ, khó chịu); có những trường hợp không thể tìm được nguyên nhân. Theo phân tích của ông Jean Marc Olivier tỷ lệ trẻ tử vong cao nhất là trong khoảng thời gian 24 giờ sau khi sinh. Vì vậy dù trẻ không tiêm chủng thì nguy cơ tử vong cũng vẫn rất cao. Nhưng nếu trẻ không được tiêm chủng thì nguy cơ mắc bệnh tật và tử vong còn cao hơn nữa.
Theo kết quả phân tích 5 trường hợp tử vong sau khi tiêm phòng vắc xin trong năm 2007 thì có 1 trường hợp là không liên quan đến vắc xin, 2 trường hợp là do phản ứng quá mẫn chậm và 2 trường hợp là do sốc phản vệ. Còn trong những tháng đầu năm 2008 có 6 trường hợp trẻ em tử vong sau khi tiêm phòng vắc xin trong đó có 4 trường hợp không có liên quan tới vắc xin tiêm phòng và 2 trường hợp chưa rõ nguyên nhân. Từ những phân tích nêu trên của các cơ quan chuyên môn, có thể khẳng định tiêm phòng vắc xin không gây tử vong ở trẻ mà ngược lại nó sẽ giúp trẻ tránh được bệnh tật đặc biệt là các bệnh truyền nhiễm.
Thông tin trẻ tử vong sau khi tiêm phòng vắc xin đã gây ảnh hưởng rất lớn đến niềm tin và sự hưởng ứng của cộng đồng, các bậc cha mẹ và tâm lý cán bộ y tế. Ảnh hưởng trực tiếp của thông tin này là tỷ lệ tiêm chủng đầy đủ cho trẻ dưới 1 tuổi ở nước ta đã giảm đáng kể từ 95% năm 2006 xuống còn 81,2% năm 2007. Nếu tình hình này không được cải thiện thì kết quả công tác tiêm chủng mở rộng của chúng ta trong những năm qua sẽ không giữ được, ông Nguyễn Trần Hiển, Viện trưởng Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ương cho biết.